Un pilote de l'armée de l'air, doué mais réfractaire à toute forme d'autorité, participe à une expérience de miniaturisation où il doit se retrouver injecté à l'intérieur d'un lapin. Mais les scientifiques étant parfois distraits, c'est dans la fesse d'un hypocondriaque notoire qu'il commence son aventure intérieure, aux commandes de son sous-marin de poche. Avec une bande de trafiquants internationaux accrochés à ses mini-basques.
Faraday, un médecin de campagne aux origines modestes, est appelé à Hundreds Hall, une demeure du XVIIIe siècle qui a beaucoup perdu de son lustre. Alors qu'il doit soigner une servante, il devient ami avec Caroline, la vieille fille de la famille, et son frère, Roderick, un ancien pilote...
Quand elle était enfant, l'agent M a vu les Men in Black effacer la mémoire de ses parents. Elle n'a rien oublié et est bien décidée à intégrer ce corps d'élite. Recrutée par l'agent O, elle doit faire équipe avec l'agent H. Ils ont pour mission de découvrir qui est la taupe de l'organisation et la mettre hors d'état de nuire...
Petit Vampire, qui a dix ans depuis trois cents ans, veut aller à l'école pour se faire des amis. Il rencontre Michel, un orphelin turbulent. Les deux garçons deviennent inséparables. Ensemble, ils vont affronter le redoutable Gibbous, un monstre à tête de Lune, qui veut se débarrasser des morts-vivants...
Dans une maison isolée au milieu d'une plaine désertique, Will consacre une bonne partie de son temps à suivre sur des écrans la vie de celles et ceux à qui il a donné la possibilité d'exister. Sa mission consiste en effet à sélectionner les âmes à même de s'incarner dans un corps humain. Lorsque la jeune Amanda meurt, Will doit "recruter" une nouvelle âme. Candidates et candidats à la vie terrestre se présentent à lui.
A San Francisco, Eddie Brock, journaliste, signe une interview qui lui coûte sa carrière et son futur mariage avec sa fiancée. Menant désormais une vie misérable, il est contacté par une scientifique qui lui demande d'enquêter sur les pratiques non éthiques de son patron, le richissime Carlton Drake...
Depuis plus de dix ans, Andy et Vicky sont constamment entre deux déménagements pour échapper à une agence fédérale obscure qui cherche à capturer leur fille Charlie. Elle dispose d'une faculté extraordinaire de pyrokinésie dont l'agence aimerait se servir pour créer une arme de destruction massive... Andy a appris à sa fille à maîtriser sa colère ou sa douleur qui déclenchent son pouvoir. Mais Charlie a désormais 11 ans et elle a de plus en plus de mal à maîtriser ses émotions. Lorsque l'agence découvre le lieu où elle et ses parents séjournent, un mystérieux agent est envoyé en mission pour traquer la famille et s'emparer de Charlie. Mais la jeune fille ne compte pas se laisser faire...
Un couple de jeunes mariés, les Maitland, se tue dans un accident de voiture. Devenus fantômes, encore peu habitués à leur condition, ils voient leur jolie maison du Connecticut envahie par une bruyante famille new yorkaise, les Deetz : un homme d'affaires cynique, une artiste extravagante et leur fille "gothique". Ils tentent de les effrayer pour s'en débarrasser, mais les très snobs Deetz s'en amusent ! Alors, ils font appel à un fantôme réputé pour terroriser les humains, Bételgeuse - alias Beetlejuice !
Chargés de protéger la Terre de toute infraction extraterrestre et de réguler l'immigration intergalactique sur notre planète, les Men in black opèrent dans le plus grand secret. Récemment séparé de son vieux partenaire, retourné à la vie civile sans aucun souvenir de sa vie d'homme en noir, K, le plus expérimenté des agents du MIB décide de former J, un jeune policier. Ensemble, ils vont affronter une nouvelle menace venue de l'espace : Edgar le cafard...
Un homme se réveille soudainement dans un train se dirigeant vers Chicago. Totalement amnésique, il ne souvient pas être être monté dans ce train. Perdu, cet homme apprend par Christina Warren, la passagère qui l'accompagne et qui semble être sa compagne, qu'il s'appelle Coller Stevens. Alors qu'il cherche à comprendre ce qu'il fait là, une bombe explose en tuant tous les passagers...